生命情報学キーノート

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商品紹介

大学1〜2年の学生を対象としたバイオインフォマティクス(生命情報学)の入門書。生命情報学の基本的内容が52の項目に分けて記述されている。

目次

  • 生命情報学キーノート

    ―目次―

    A 生命情報学の全体像
     生命情報学の展望
     生命情報学とインターネット
     WWW上の役に立つ生命情報学サイト

    B データの獲得
     DNA、RNA、タンパク質の配列決定
     タンパク質構造の決定方法
     遺伝子とタンパク質の発現情報
     タンパク質相互作用データ

    C データベースー内容、構造、アノテーション
     ファイル形式
     アノテーションされた配列データベース
     ゲノムや生物種に特化したデータベース
     雑多なデータベース

    D 生物学データの取得
     EntrezとDBGET/LinkDBを用いたデータの取得
     SRS(配列取得システム)を用いたデータの取得

    E 配列類似性の基準によるデータベースの配列検索
     配列の類似性検索
     アミノ酸置換行列
     データベース検索:FASTAとBLAST
     配列の浄化
     反復データベース検索検索とPSI-BLAST

    F 多重配列アラインメント:遺伝子およびタンパク質ファミリー
     多重配列アラインメントとファミリー関係
     タンパク質ファミリーとパターンデータベース
     タンパク質ドメインファミリー

    G 系統学
     系統学、分岐学、オントロジー
     系統樹作成
     高分子配列の進化

    H 配列アミノテーション
     ゲノムアノテーションの原理
     アノテーションツールと資源

    I 構造情報学
     概念モデルとタンパク質の立体構造
     タンパク質三次元構造とタンパク質機能との関連
     タンパク質の構造と機能の進化
     構造データの入手、視覚化と解析
     構造アラインメント
     既知の三次元構造に基づくタンパク質の分類:CATHとSCOP
     タンパク質の構造予測入門
     比較モニタリング法による構造予測
     二次構造予測
     より進んだタンパク質の構造予測と予測戦略

    J マイクロアレイのデータ解析
     マイクロアレイデータ:解析方法
     マイクロアレイデータ:ツールと資源
     配列サンプリングとSAGE

    K プロテオミクスデータ解析
     二次元電気泳動のデータ解析
     タンパク質の質量分析データ解析

    L 高次システム
     分子経路のモデル化と再構成
     タンパク質相互作用の情報学
     高次モデル

    M 生物学における化学情報資源
     分子表記の規則
     化学情報学の資源

    N 創薬産業における生命情報学
     生命情報学と創薬
     製薬情報学の資源

    O 生命情報学における計算機処理の基本原理
     コンピュータソフトウェアの実行
     コンピュータオプレーティングシステム
     ソフトウェアのダウンロードとインストール
     データベースの操作

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