実験医学別冊 今すぐ始める! メタゲノム解析 実験プロトコール
商品紹介
試料の採取・保存法は？コンタミを防ぐコツは？データ解析のポイントは？ 腸内，口腔，皮膚，環境など多様な微生物叢を対象に広がる「メタゲノム解析」．その実践に必要なすべてのノウハウを1冊に凝縮しました．
目次
- 実験医学別冊 今すぐ始める！ メタゲノム解析 実験プロトコール
―目次―
特集 今すぐ始める！ メタゲノム解析 実験プロトコール
第1章 メタゲノム解析の基本知識
1．メタゲノム解析技術のオーバービュー
2．メタゲノムデータの情報解析のオーバービュー
3．細菌の分類
第2章 メタゲノム・メタ16S解析の実際
1．腸内細菌叢のメタゲノム解析・メタ16S解析
2．日本人腸内細菌叢のメタゲノム解析と特徴解明
腸内細菌叢の研究事例(1)
3．アジア人の腸内細菌叢の多様性と比較解析
腸内細菌叢の研究事例(2)
4．小児疾患の腸内細菌叢のメタ16S解析
腸内細菌叢の研究事例(3)
5．多発性硬化症の腸内細菌叢のメタ16S解析
腸内細菌叢の研究事例(4)
6．アルコール依存症患者の糞便菌叢のメタ16S解析
腸内細菌叢の研究事例(5)
7．唾液細菌叢のメタゲノム解析・メタ16S解析
8．歯垢検体の保存・管理と細菌叢のメタ16S解析
9．舌苔細菌叢のメタ16S解析
10．ヒト皮膚細菌叢のメタ16S解析
11．中耳細菌叢のメタ16S解析
12．胃細菌叢メタ16S解析 口腔，腸細菌叢との比較
13．羊水試料のメタ16S解析
14．土壌細菌叢のメタ16S・ショットガンメタゲノム解析
15．下水処理を担う複合微生物系「活性汚泥」のメタ16S解析
16．植物共生細菌群集のメタゲノム解析
第3章 発展的なメタゲノム関連解析
1．メタトランスクリプトーム解析
2．古代試料のメタゲノム解析
3．PacBioロングリードを用いたメタゲノム解析
4．皮膚における真菌叢の解析
5．メタゲノム解析による臨床検体からの病原体探索
6．環境DNA解析
第4章 細菌叢研究を支える重要技術
1．無菌動物とノトバイオート技術
2．メタボロミクスを基盤とした腸内環境研究
3．ミリューリピドミクス解析 腸内細菌と宿主との共生関係から
生まれる脂質代謝クロストークの総体を捉える
4．統合オーミクス解析
第5章 データベースとインフォマティクス
1．メタゲノム解析におけるデータベースの現状と課題
2．ヒト腸内細菌叢のメタゲノムデータのインフォマティクス
3．微生物叢の生理代謝機能を評価するMAPLEシステム
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