1) Wissing DR & Timm D : Statistics for the nonstatistician : Part I. South Med J, 105 : 126-130, 2012
医療統計、データ解析しながらいつの間にか基本が身につく本
商品紹介
臨床研究に必要なところだけコンパクトに解説！統計の基本を読みながら，付属のサンプルデータを使い29の課題に沿って実際にデータ解析をやってみることで，難しいと思っていた医療統計もすんなりわかる．
目次
- 講義編
講義編を読む前に
第１章 私たちは，なぜ臨床研究をするのか？
第２章 臨床研究はどう行う？ ～CQから統計解析・論文作成まで
第３章 その臨床研究は実施可能？ ～PECOとFINER
第４章 仮説検定とは ～P 値と信頼区間
実践編
実践編をはじめる前に
F先生の行った研究の抄録と図表
課題一覧
実践編の構成
第５章 Stataの概要
課題1 変数一覧を確認する
課題2 データを閲覧する
第６章 検定方法はどれが適切？
第７章 図表の作成 ～度数分布表・分割表，ヒストグラム，箱ひげ図，散布図
課題3 全患者の男女それぞれの割合を確認する（度数分布表）
課題4 全患者のBMIカテゴリごとの割合を確認する（度数分布表）
課題5 全患者のCRP値をグラフ（ヒストグラム）にして，全体像を確認する
課題6 全患者のCRP値をグラフ（箱ひげ図）にして，全体像を確認する
課題7 全患者の身長と体重の関係を確認する（散布図）
第８章 代表値を確認する
課題8 全患者の男女それぞれの代表値（割合）を確認する
課題9 全患者のBMIカテゴリごとの代表値（割合）を確認する
課題10 全患者のCRP値（正規分布）の代表値（平均・標準偏差）を確認する
課題11 全患者の在院日数（非正規分布）の代表値（中央値・四分位範囲）を確認する
第９章 2群間のカテゴリ変数の比較検定 ～カイ二乗検定，Fisherの正確確率検定
課題12 新規治療Xと標準治療の男女の割合の差を検定する
第10章 2群間の連続変数の比較検定
～Studentのt 検定，Wilcoxonの順位和検定/Mann-WhitneyのU 検定～
課題13 新規治療Xと標準治療のCRP値の差を検定する（Studentのt検定）
課題14 新規治療Xと標準治療の在院日数の差を検定する（Wilcoxonの順位和検定）
第11章 3 群以上の差の比較 ～分散分析，Kruskal-Wallis検定と多重比較法
課題15 BMIカテゴリ（3群）で，総コレステロール値の差を検定する（ANOVA）
課題16 BMIカテゴリ（3群）で，在院日数の差を検定する（Kruskal-Wallis検定）
第12章 重回帰分析
課題17 重回帰分析で調整変数を調整した新規治療Xと在院日数の関連を調べる
第13章 Logistic 回帰分析
課題18 Logistic回帰分析で新規治療Xと在院死亡の関連を調べる
第14章 生存時間分析 ～Kaplan-Meier 曲線，log-rank 検定，Cox 回帰
課題19 生存時間分析で新規治療Xと90日死亡の関連を調べる
結果をまとめる
第15章 データクリーニングの基礎
課題20 CSVファイルを読み込む
課題21 性別，身長，体重の変数を文字列から数値に変更する
課題22 性別の変数を数値から文字列に変更する
課題23 性別の変数を使って，femaleという新しい変数を作成する
課題24 身長「height」と体重「weight」からbmi2という新しい変数を作成する
課題25 生年月日の文字列変数「dtbirthstr」から数値の変数「birthday」を新しく作成する
課題26 変数「bmi2」を削除する
課題27 同一行の複数の変数のなかで最大値を特定し，その値を新たな変数とする結果を記録する
課題28 解析結果を記録する
課題29 コマンドを保存する
第16章 Stataを使いこなすために
おわりに
◆コラム１ 統計学に名を遺した人たち
◆コラム２ 相関分析で見ているものとは
◆コラム３ 奇跡の確率
◆コラム４ 簡単にクロス集計表の検定をしたいとき
◆コラム５ カイ二乗検定とFisherの正確確率検定の計算法
◆コラム６ 対応のない？対応のある？
◆コラム７ 分散とは？～データのバラつきをイメージする
◆コラム８ 回帰分析における基準の変更と表示
◆コラム９ 論文や学会発表で記載すべき桁数
◆コラム10 データの保存形式と文字コード
この書籍の参考文献
参考文献のリンクは、リンク先の都合等により正しく表示されない場合がありますので、あらかじめご了承下さい。
本参考文献は電子書籍掲載内容を元にしております。
講義編
P.15 掲載の参考文献
P.19 掲載の参考文献
1) 「必ずアクセプトされる医学英語論文完全攻略50の鉄則」 (康永秀生/著), 金原出版, 2016
2) 「必ず読めるようになる医学英語論文究極の検索術×読解術」 (康永秀生/著), 金原出版, 2021
P.25 掲載の参考文献
1) Choi IJ, et al : Family History of Gastric Cancer and Helicobacter pylori Treatment. N Engl J Med, 382 : 427-436, 2020
2) Mehta SR, et al : Complete Revascularization with Multivessel PCI for Myocardial Infarction. N Engl J Med, 381 : 1411-1421, 2019
3) Kang DH, et al : Early Surgery or Conservative Care for Asymptomatic Aortic Stenosis. N Engl J Med, 382 : 111-119, 2020
4) Madhi SA, et al : Respiratory Syncytial Virus Vaccination during Pregnancy and Effects in Infants. N Engl J Med, 383 : 426-439, 2020
5) Purisch SE, et al : Effect of Delayed vs Immediate Umbilical Cord Clamping on Maternal Blood Loss in Term Cesarean Delivery : A Randomized Clinical Trial. JAMA, 322 : 1869-1876, 2019
P.29 掲載の参考文献
1) Goodman SN : Toward evidence-based medical statistics. 1 : The P value fallacy. Ann Intern Med, 130 : 995-1004, 1999
実践編
P.53 掲載の参考文献
1) Student : The Probable Error of a Mean. Biometrika, 6 : 1-25, 1908
2) Magnello ME : Karl Pearson and the Origins of Modern Statistics : An Elastician becomes a Statistician. The Rutherford Journal, 1 : 2005-2006 http://www.rutherfordjournal.org/article010107.html
3) Cox DR : The Regression Analysis of Binary Sequences. J R Stat Soc Series B Stat Methodol, 20 : 215-242, 1958
4) Department of Statistics, University of Oxford. David Cox : https://web.archive.org/web/20080609200319/http:/www.stats.ox.ac.uk/people/academic_staff/david_cox
5) Lamb K & Farmer D : The genius at Guinness and his statistical legacy. The Conversation : https://theconversation.com/the-genius-at-guinness-and-his-statistical-legacy-93134
6) Encyclopedia of Mathematics. Gosset, William Sealy : https://encyclopediaofmath.org/wiki/Gosset,_William_Sealy
7) 「Student : A Statistical Biography of William Sealy Gosset」 (Pearson ES, et al,eds), Clarendon Press, 1990 https://www.gwern.net/docs/statistics/decision/1990-pearson-studentastatisticalbiographyofwilliamsealygosset.pdf
8) 「歴史と統計学 人・時代・思想」 (竹内啓/著), 日本経済新聞出版社, 2018
9) 「The Lady Tasting Tea : How Statistics Revolutionized Science in the Twentieth Century」 (Salsburg D), Henry Holt & Co, 2002
P.67 掲載の参考文献
1) 「統計学演習」 (村上正康, 安田正実/著), 培風館, 1989
2) 「基礎から学ぶ楽しい保健統計」 (中村好一/著), 医学書院, 2016
3) 「医療統計解析使いこなし実践ガイド 臨床研究で迷わない Q&A」 (対馬栄輝/編), 羊土社, 2020
4) Edwards AL : The Correlation Coefficient. Ch. 4.「An Introduction to Linear Regression and Correlation」 (Edwards AL), pp33-46, W. H. Freeman, 1976
P.75 掲載の参考文献
1) 「統計学入門」 (東京大学教養学部統計学教室/編), 東京大学出版会, 1991
P.85 掲載の参考文献
1) Pearson K : X. On the criterion that a given system of deviations from the probable in the case of a correlated system of variables is such that it can be reasonably supposed to have arisen from random sampling. The London, Edinburgh, and Dublin Philosophical Magazine and Journal of Science, 50 : 157-175, 1900
2) 「Mathematical Methods of Statistics Princeton Landmarks in Mathematics」 (Cramer H), Princeton University Press, 1946
3) Agresti A : A Survey of Exact Inference for Contingency Tables. Statist. Sci., 7 : 131-153, 1992
4) Fisher RA : On the Interpretation of χ2 from Contingency Tables, and the Calculation of P. J R Stat Soc, 85 : 87-94, 1922
5) Lydersen S, et al : Recommended tests for association in 2 x 2 tables. Stat Med, 28 : 1159-1175, 2009
6) Lydersen S, et al : Choice of test for association in small sample unordered r x c tables. Stat Med, 26 : 4328-4343, 2007
7) Martin Andres A, et al : Comments on "Two-tailed significance tests for 2 × 2 contingency tables : What is the alternative?" by Robin J Prescott Statistics in Medicine 2019 ; 38 : 4264-4269. Stat Med, 39 : 510-513, 2020
8) Prescott RJ : Two-tailed significance tests for 2 × 2 contingency tables : What is the alternative? Stat Med, 38 : 4264-4269, 2019
9) 松山裕 : カテゴリカルデータの解析 (< 連載> 統計学再入門 第4回). 心身医学, 53 : 874-879, 2013
10) 「医療統計解析使いこなし実践ガイド 臨床研究で迷わない Q&A」 (対馬栄輝/編), 羊土社, 2020
11) 「統計学演習」 (村上正康, 安田正実/著), 培風館, 1989
12) 「Rによる統計解析の基礎」 (中澤港/著), ピアソン・エデュケーション, 2003
P.89 掲載の参考文献
1) Pearson K : X. On the criterion that a given system of deviations from the probable in the case of a correlated system of variables is such that it can be reasonably supposed to have arisen from random sampling. The London, Edinburgh, and Dublin Philosophical Magazine and Journal of Science, 50 : 157-175, 1900
2) 「Mathematical Methods of Statistics Princeton Landmarks in Mathematics」 (Cramer H), Princeton University Press, 1946
3) Agresti A : A Survey of Exact Inference for Contingency Tables. Statist. Sci. 7 : 131-153, 1992
4) Fisher RA : On the Interpretation of χ2 from Contingency Tables, and the Calculation of P. J R Stat Soc, 85 : 87-94, 1922
5) 松山裕 : カテゴリカルデータの解析 (<連載> 統計学再入門 第4回). 心身医学, 53 : 874-879, 2013
6) 「医療統計解析使いこなし実践ガイド 臨床研究で迷わない Q&A」 (対馬栄輝/編), 羊土社, 2020
7) Lydersen S, et al : Recommended tests for association in 2 × 2 tables. Stat Med, 28 : 1159-1175, 2009
8) Richardson JT : The analysis of 2 × 2 contingency tables--yet again. Stat Med, 30 : 890 ; author reply 891-892, 2011
P.93 掲載の参考文献
1) Pearson K : X. On the criterion that a given system of deviations from the probable in the case of a correlated system of variables is such that it can be reasonably supposed to have arisen from random sampling. The London, Edinburgh, and Dublin Philosophical Magazine and Journal of Science, 50 : 157-175, 1900
2) 「Mathematical Methods of Statistics Princeton Landmarks in Mathematics」 (Cramer H), Princeton University Press, 1946
3) Agresti A : A Survey of Exact Inference for Contingency Tables. Statist. Sci. 7 : 131-153, 1992
4) Fisher RA : On the Interpretation of χ2 from Contingency Tables, and the Calculation of P. J R Stat Soc, 85 : 87-94, 1922
5) 松山裕 : カテゴリカルデータの解析 (<連載> 統計学再入門 第4回). 心身医学, 53 : 874-879, 2013
6) 「医療統計解析使いこなし実践ガイド 臨床研究で迷わない Q&A」 (対馬栄輝/編), 羊土社, 2020
7) 竹森幸一 : 統計学入門書にみられるFisherの直接確率法の両側確率と片側確率をめぐる混乱. 青森保健大雑誌, 7 : 187-190, 2006
P.108 掲載の参考文献
1) 松山裕 : 連続データの解析 (<連載> 統計学再入門 第5回). 心身医学, 53 : 953-957, 2013
2) Student : The Probable Error of a Mean. Biometrika, 6 : 1-25, 1908
3) Wilcoxon F : Individual Comparisons by Ranking Methods. Biometrics Bulletin, 1 : 80-83, 1945
4) 「Nonparametric Statistics for the Behavioral Sciences 2nd edition」 (Siegel S & John CN), McGraw-Hill College, 1988
5) 池田郁男 : 統計検定を理解せずに使っている人のために II. 化学と生物, 51 : 408-417, 2013
P.109 掲載の参考文献
1) 「広辞苑 第七版」 (新村出/編), 岩波書店, 2018
P.123 掲載の参考文献
1) 「統計学演習」 (村上正康, 安田正実/著), 培風館, 1989
2) 「Rによる統計解析の基礎」 (中澤港/著), ピアソン・エデュケーション, 2003
3) 松山裕 : 連続データの解析 (<連載> 統計学再入門 第5回). 心身医学, 53 : 953-957, 2013
4) 「医療統計解析使いこなし実践ガイド 臨床研究で迷わない Q&A」 (対馬栄輝/編), 羊土社, 2020
5) Kruskal WH & Wallis WA : Use of Ranks in One-Criterion Variance Analysis. Journal of the American Statistical Association, 47 : 583-621, 1952
6) 池田郁男 : 改訂増補版 : 統計検定を理解せずに使っている人のために III. 化学と生物, 57 : 629-647, 2019
P.125 掲載の参考文献
1) 「完全独習 統計学入門」 (小島寛之/著), ダイヤモンド社, 2006
2) 池田郁男 : 統計検定を理解せずに使っている人のために I. 化学と生物, 51 : 318-325, 2013
P.132 掲載の参考文献
1) Slinker BK & Glantz SA : Multiple linear regression : accounting for multiple simultaneous determinants of a continuous dependent variable. Circulation, 117 : 1732-1737, 2008
P.141 掲載の参考文献
1) Stoltzfus JC : Logistic regression : a brief primer. Acad Emerg Med, 18 : 1099-1104, 2011
2) Hess AS & Hess JR : Logistic regression. Transfusion, 59 : 2197-2198, 2019
3) LaValley MP : Logistic regression. Circulation, 117 : 2395-2399, 2008
4) Zhang J & Yu KF : What's the relative risk? A method of correcting the odds ratio in cohort studies of common outcomes. JAMA, 280 : 1690-1691, 1998
P.157 掲載の参考文献
1) Benitez-Parejo N, et al : Survival analysis and Cox regression. Allergol Immunopathol (Madr), 39 : 362-373, 2011
2) George B, et al : Survival analysis and regression models. J Nucl Cardiol, 21 : 686-694, 2014
3) Stolberg HO, et al : Survival analysis. AJR Am J Roentgenol, 185 : 19-22, 2005
4) Zhang Z, et al : Time-varying covariates and coefficients in Cox regression models. Ann Transl Med, 6 : 121, 2018
P.163 掲載の参考文献
1) The New England Journal of Medicine. New Manuscripts : https://www.nejm.org/author-center/new-manuscripts
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