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実験医学別冊　新世代フローサイトメトリー活用スタンダード

出版社： 羊土社
発行日： 2021-12-15
分野： 医学一般  >  雑誌
ISSN： 02885514
雑誌名：
特集： 新世代フローサイトメトリー活用スタンダード
電子書籍版： 2021-12-15 （第1刷）
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目次

  • 特集　新世代フローサイトメトリー活用スタンダード
    　　　生物学・医学・創薬研究で定量・多色解析を活かす！
    　　　基本原理の理解と実践プロトコール

    第1章　フローサイトメトリーを知る
    　1　ハイパラメーターフローサイトメーターの特徴について ～フローサイトメーター装置の理解
    　2　蛍光色素と蛍光補正
    　3　抗体パネルのデザイン
    　4　目的に応じたパネル最適化 〜対象分子の生物学的特性の知識の必要性

    第2章　フローサイトメトリーを使う
    I　基礎科学研究・細胞内
    　1　Fucciを用いた細胞周期解析
    　2　細胞内染色法を用いたサイトカイン産生の解析
    　3　培養細胞のリソソーム活性測定法
    　　　～Lysosomal-METRIQ プローブを用いた蛍光比率によるリソソーム活性測定
    　4　マスサイトメトリーを用いたヒストン修飾・細胞内シグナル伝達の解析
    II　基礎科学研究・細胞外
    　1　造血幹細胞のクローンソートとMoFlo，Index sorting
    　2　ヒトがん細胞のソーティング
    　3　がん異種移植マウスモデルを用いた転移がん細胞の分離
    　4　間葉系幹細胞のソーティング
    　5　iPS 細胞からの血球細胞分化誘導とフローサイトメトリー解析
    　6　末梢組織に局在するさまざまな免疫担当細胞の表現型および機能解析
    III　トランスレーショナル研究
    　1　マスサイトメトリーによる腫瘍浸潤リンパ球のマルチカラー解析
    　2　創薬における薬剤スクリーニングのためのフローサイトメーターを用いた細胞内シグナル分子解析
    　3　造血器腫瘍におけるマルチカラーフローサイトメトリー検査の有用性
    　4　MAIT細胞解析
    　5　T 細胞のミトコンドリアとPD-1 染色
    　6　脳内免疫細胞のフローサイトメトリー解析
    　7　外科手術後がん組織検体を用いたがん微小環境の多重染色ハイパラメーター解析
    　8　非臨床試験における非ヒト霊長類検体を用いた免疫学的解析

    第3章　フローサイトメトリーの未来
    　1　BD FACSymphony S6を用いた抗原特異的B 細胞ソーティング
    　2　Cytek Auroraを用いた抗原特異的T細胞表現型解析
    　3　ゴーストサイトメトリー
    　4　スペクトル型セルアナライザー
    　5　フローサイトメーターを用いたエクソソームの解析
    　6　機械学習を用いたFCMデータ解析 〜次元圧縮手法の原理と事例

    座談会
    　コアラボマネージャーに訊くFCMの落とし穴と成功のコツ

この書籍の参考文献

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本参考文献は電子書籍掲載内容を元にしております。

第1章 フローサイトメトリーを知る

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第2章 フローサイトメトリーを使う

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第3章 フローサイトメトリーの未来

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5) Ferrer-Font L, et al : Cytometry A, 97 : 824-831, 2020
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7) Rydyznski Moderbacher C, et al : Cell, 183 : 996-1012.e19, 2020
 
8) Woldemeskel BA, et al : J Clin Invest, 131 : doi : 10.1172/JCI149335, 2021
 
9) Dan JM, et al : J Immunol, 197 : 983-993, 2016
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10) Wu H, et al : Blood Adv, 3 : 2153-2163, 2019
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11) Ueno H, et al : Nat Immunol, 16 : 142-152, 2015
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12) Schmitt N, et al : Trends Immunol, 35 : 436-442, 2014
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1) Ota S, et al : Science, 360 : 1246-1251, 2018
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2) Ugawa M, et al : eLife (accepted)
 
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2) Wilder ME & Cram LS : J Histochem Cytochem, 25 : 888-891, 1977
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3) De Rosa SC, et al : Nat Med, 7 : 245-248, 2001
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4) Fontenot JD, et al : Nat Immunol, 4 : 330-336, 2003
 
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6) Chattopadhyay PK & Roederer M : Methods, 57 : 251-258, 2012
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8) Futamura K, et al : Cytometry A, 87 : 830-842, 2015
PubMed
9) 古木基裕 : スペクトル解析型セルアナライザー「新版 フローサイトメトリー もっと幅広く使いこなせる!」 (中内啓光/監, 清田純/編), pp284-292, 羊土社, 2016
 
10) 戸村道夫, 二村孝治 : Q17 一般的な光電子増倍管 (PMT) による検出以外にはどのような方法がありますか? 「実験医学別冊 ラボ必携 フローサイトメトリー Q&A」 (戸村道夫/編), pp62-63, 羊土社, 2017
 
11) YouTube「スペクトル型セルアナライザー : Introduction of Spectral Cell Analyzer【ソニー公式】」https://youtu.be/sv-UbkxiL2w
 
12) Schmutz S, et al : PLoS One, 11 : e0159961, 2016
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13) Nguyen R, et al : Cytometry A, 83 : 306-315, 2013
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3) Hinger SA, et al : Sci Rep, 10 : 15804, 2020
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5) Zhang B, et al : Front Immunol, 5 : 518, 2014
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6) Welsh JA, et al : J Extracell Vesicles, 9 : 1713526, 2020
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1) Bendall SC, et al : Trends Immunol, 33 : 323-332, 2012
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2) Hwang B, et al : Exp Mol Med, 50 : 1-14, 2018
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4) 露崎弘毅 : Benchmarking principal component analysis for large-scale single-cell RNA-sequencing. https://www.slideshare.net/antiplastics/benchmarking-principal-component-analysis-for-largescale-singlecell-rnasequencing
 
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6) Ringner M : Nat Biotechnol, 26 : 303-304, 2008
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13) Becht E, et al : Nat Biotechnol : doi : 10.1038/nbt.4314, 2018
 
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15) Wolf FA, et al : Genome Biol, 19 : 15, 2018
 
16) Butler A, et al : Nat Biotechnol, 36 : 411-420, 2018
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21) Olsen LR, et al : Cytometry A, 95 : 156-172, 2019
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22) Finak G, Jiang M「flow Workspace : Infrastructure for representing and interacting with the gated cytometry」http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/flowWorkspace.html
 
23) Finak G, et al : PLoS Comput Biol, 10 : e1003806, 2014
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24) Chevrier S, et al : Cell Syst, 6 : 612-620.e5, 2018
 
25) Dai Y, et al : BMC Bioinformatics, 22 : 138, 2021
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26) 「OMIQ」https://www.omiq.ai/
 
27) 「FCS Express」https://denovosoftware.com/
 
28) 「Cytobank」https://www.cytobank.org/
 

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