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実験医学別冊 リアルタイム・デジタルPCR実験スタンダード

出版社: 羊土社
発行日: 2022-02-01
分野: 医学一般  >  雑誌
ISSN: 02885514
雑誌名:
特集: リアルタイム・デジタルPCR実験スタンダード
電子書籍版: 2022-02-01 (第1刷)
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目次

  • 第0部 基礎の基礎
     核酸の基礎知識とPCRの基本原理

    第1部 リアルタイムPCR
    基本編
     1 リアルタイムPCRの原理
     2 リアルタイムPCRの定量方法
     3 転写産物からの遺伝子発現解析の流れ
     4 遺伝子発現量の測定の実際
     5 SNPのタイピングの原理
     6 マルチプレックスPCRの設計
     7 特異的アレルの検出の原理
     8 プライマー/プローブの設計手順
    実践編
     発現解析(mRNA,miRNA)
     1 経時的な遺伝子発現解析で概日リズムを量る
     2 遺伝子発現抑制効果を評価する
     3 遺伝子変異を検出する
     4 リアルタイムPCR・デジタルPCRを用いた環境DNAによる水生生物の生息把握
     5 網羅的な発現をみる
     6 内在性コントロール遺伝子の設定について
     7 miRNA生合成経路をみる
     8 TaqMan®Arrayプレートによる遺伝子発現プロファイリング
     細胞外RNA(エクソソームRNA)解析
     9 加齢に伴って減少する血中miRNA
     10 細胞外miRNAを捉える
     ウイルスの検出
     11 下水からの新型コロナウイルスの検出
     12 ウイルス感染症を診断する
     13 新型コロナウイルス変異株の検出・解析法
     遺伝⼦タイピング
     14 TaqMan®プローブを使ったタイピングの実際
     15 ゲノム上の遺伝子量に関する解析
     エピジェネティクス
     16 エピジェネティクスな状態を知る

    第2部 デジタルPCR
    基本編
     1 デジタルPCRの原理と応用
    実践編
     1 デジタルPCRによる免疫受容体のコピー数多型解析
     2 診断のための遺伝子変異の検出
     3 ddPCRによるBRAF変異の検出
     4 デジタルPCRを用いた神経芽腫微小残存病変の評価法
     5 デジタルPCRによるmiRNAの測定
     6 デジタルPCRを用いたcfDNAのDNAメチル化解析
     7 肺がん患者血漿のデジタルPCRを用いた遺伝子変異解析
     8 シングルセルドロップレットデジタルPCR法

この書籍の参考文献

参考文献のリンクは、リンク先の都合等により正しく表示されない場合がありますので、あらかじめご了承下さい。

本参考文献は電子書籍掲載内容を元にしております。

第0部 基礎の基礎

P.14 掲載の参考文献
1) 「基礎から学ぶ遺伝子工学 第2版」 (田村隆明/著), 羊土社, 2017
2) 北條浩彦 : ぶんせき, 524 : 308-314, 2018
3) 「原理からよくわかる リアルタイムPCR完全実験ガイド」 (北條浩彦/編), 羊土社, 2013

第1部 リアルタイムPCR

P.21 掲載の参考文献
2) 「バイオ実験で失敗しない! 検出と定量のコツ」 (森山達哉/編), 羊土社, 2005
3) 北條浩彦 : ぶんせき, 524 : 308-314, 2018
4) 「原理からよくわかる リアルタイムPCR完全実験ガイド」 (北條浩彦/編), 羊土社, 2013
P.32 掲載の参考文献
1) 「Real-time PCR」 (Dorak MT ed), Taylor & Francis, 2006
2) 「バイオ実験で失敗しない! 検出と定量のコツ」 (森山達哉/編), 羊土社, 2005
3) 北條浩彦 : ぶんせき, 524 : 308-314, 2018
4) 「原理からよくわかる リアルタイムPCR完全実験ガイド」 (北條浩彦/編), 羊土社, 2013
P.41 掲載の参考文献
2) 「基礎から学ぶ 遺伝子工学」 (田村隆明/著), 羊土社, 2012
3) 北條浩彦 : ぶんせき, 524 : 308-314, 2018
4) 「原理からよくわかる リアルタイムPCR完全実験ガイド」 (北條浩彦/編), 羊土社, 2013
P.46 掲載の参考文献
P.53 掲載の参考文献
1) 「国際HapMapプロジェクトHP」//www.hapmap.org/index.html.ja
2) 「NCBI dbSNP」//www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
3) Kutyavin IV, et al : Nucleic Acids Res, 28 : 655-661, 2000
P.78 掲載の参考文献
4) 「BLAST」 (Bedell J, et al), O'Reilly & Associates, 2003
5) Rozen S & Skaletsky H : Methods Mol Biol, 132 : 365-386, 2000
P.87 掲載の参考文献
P.96 掲載の参考文献
2) Jackson AL, et al : RNA, 12 : 1179-1187, 2006
3) Birmingham A, et al : Nat Methods, 3 : 199-204, 2006
5) Fakhr E, et al : Cancer Gene Ther, 23 : 73-82, 2016
6) Naito Y, et al : BMC Bioinformatics, 10 : 392, 2009
P.101 掲載の参考文献
1) Davies H, et al : Nature, 417 : 949-954, 2002
2) Schwarzenbach H, et al : Nat Rev Cancer, 11 : 426-437, 2011
3) Didelot A, et al : Exp Mol Pathol, 92 : 275-280, 2012
4) Ashida A, et al : Int J Clin Oncol, 21 : 981-988, 2016
5) Ashida A, et al : Acta Derm Venereol, 99 : 1184-1185, 201
P.110 掲載の参考文献
P.122 掲載の参考文献
P.130 掲載の参考文献
P.140 掲載の参考文献
1) Matsuyama H & Suzuki HI : Int J Mol Sci, 21 : doi : 10.3390/ijms21010132, 2019
5) Suzuki HI, et al : Cell, 168 : 1000-1014.e15, 2017
6) Whyte WA, et al : Cell, 153 : 307-319, 2013
7) Hnisz D, et al : Cell, 169 : 13-23, 2017
P.150 掲載の参考文献
P.157 掲載の参考文献
P.163 掲載の参考文献
3) Buck AH, et al : Nat Commun, 5 : 5488, 2014
5) Donati S, et al : Int J Mol Sci, 20 : doi : 10.3390/ijms20184353, 2019
6) Srinivasan S, et al : Cell, 177 : 446-462.e16, 2019
P.171 掲載の参考文献
1) Kitajima M, et al : Sci Total Environ, 739 : 139076, 2020
2) 「日本水環境学会COVID-19タスクフォース」//www.jswe.or.jp/aboutus/pdf/SARS-CoV-2_RNA_Detection_Manual_for_Wastewater.pdf (2021)
3) Haramoto E, et al : Water Res, 135 : 168-186, 2018
4) 「IDEXX Laboratories」//www.idexx.com/files/sample-concentration-protocol-for-wastewater-surveillance.pdf (2020)
5) 「CDC」//www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/rt-pcr-panel-primer-probes.html (2020)
6) 「山梨大学プレスリリース」//www.yamanashi.ac.jp/wp-content/uploads/2021/09/202109015pr.pdf (2021)
P.190 掲載の参考文献
1) Chadha J, et al : Environ Microbiol : doi : 10.1111/1462-2920.15687, 2021
2) 「GISAID Genomic epidemiology of hCoV-19」//www.gisaid.org/
P.197 掲載の参考文献
P.202 掲載の参考文献
1) Redon R, et al : Nature, 444 : 444-454, 2006
2) Relative Quantitation Of Gene Expression : ABI PRISM 7700 Sequence Detection System : User Bulletin #2 : Rev B (サーモフィッシャーサイエンティフィック社HPよりダウンロード)
P.216 掲載の参考文献

第2部 デジタルPCR

P.234 掲載の参考文献
P.243 掲載の参考文献
3) 佐伯亘平, 他 : 獣医畜産新報, 69 : 596-597, 2016
4) 佐伯亘平 : 犬と猫の検査・手技ガイド 2019 (辻本元, 他/編), pp731-733, EDUWARD press, 2019
P.250 掲載の参考文献
1) Merker JD, et al : J Clin Oncol, 36 : 1631-1641, 2018
4) 後藤悌 : 肺がん, 60 : 90-98, 2020
6) Ashida A, et al : Acta Derm Venereol, 99 : 1184-1185, 2019
P.257 掲載の参考文献
P.264 掲載の参考文献
P.272 掲載の参考文献
1) Shinjo K, et al : PLoS One, 15 : e0233782, 2020
2) Church TR, et al : Gut, 63 : 317-325, 2014
3) D'Andrea E, et al : Cancer Med, 9 : 824-836, 2020
4) Shen SY, et al : Nature, 563 : 579-583, 2018
5) Liu MC, et al : Ann Oncol, 31 : 745-759, 2020
6) Taryma-Lesniak O, et al : Clin Epigenetics, 12 : 100, 2020
P.282 掲載の参考文献
1) Sakai K, et al : Mol Oncol, 15 : 126-137, 2021
2) Iwama E, et al : Cancer, 126 : 219-227, 2020
3) Hindson BJ, et al : Anal Chem, 83 : 8604-8610, 2011
4) Tarailo-Graovac M & Chen N : Curr Protoc Bioinformatics, Chapter 4 : Unit 4.10, 2009
5) Fraga D, et al : Curr Protoc Essential Lab Techn, 8 : 10.3.1-10.3.40, 2014
6) Kutyavin IV, et al : Nucleic Acids Res, 28 : 655-661, 2000
P.291 掲載の参考文献
1) Mukherjee S & Thrasher AJ : Gene, 525 : 174-181, 2013
2) Touzot F, et al : Expert Opin Biol Ther, 14 : 789-798, 2014
3) Igarashi Y, et al : Mol Ther Methods Clin Dev, 6 : 8-16, 2017
4) Gaspar HB, et al : Blood, 114 : 3524-3532, 2009
5) Mitchell BS, et al : Proc Natl Acad Sci U S A, 75 : 5011-5014, 1978
6) Aiuti A, et al : Science, 296 : 2410-2413, 2002
7) Cooper AR, et al : Blood, 129 : 2624-2635, 2017
8) Otsu M, et al : J Clin Immunol, 35 : 384-398, 2015
9) Sato T, et al : J Mol Diagn, 22 : 132-140, 2020

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