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実験医学別冊 改訂版 もっとよくわかる!腸内細菌叢

出版社: 羊土社
発行日: 2022-11-25
分野: 医学一般  >  雑誌
ISBN: 9784758122115
ISSN: 02885514
雑誌名:
特集: 改訂版 もっとよくわかる!腸内細菌叢
電子書籍版: 2022-11-25 (第2版第1刷)
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目次

  • 特集 改訂版 もっとよくわかる!腸内細菌叢
       “もう1つの臓器”を知り、健康・疾患を制御する!

    第I部 腸内細菌の基礎知識
     1章 腸内細菌研究ことはじめ
      1 腸内細菌の発見から20世紀前半まで―便の観察からはじまった
      2 20世紀後半―腸内細菌の培養・同定・分類法の確立
      3 そして腸内マイクロバイオーム研究へ
     2章 腸内細菌と健康・疾患
      1 腸内細菌の分類・命名
      2 ヒトの健康と腸内細菌叢
      3 ヒトの疾患と腸内細菌叢
     3章 生体バリアと腸内細菌叢
      1 物理的・化学的バリア
      2 生物学的バリア(粘膜免疫系)
      3 環境因子としてのバリア(常在細菌)
      4 免疫系の修飾(TLR・NLRなどを介した作用)

    第II部 腸内細菌叢とヒトの疾患
     4章 腸内細菌のはたらき
      1 腸内細菌にとっての栄養
      2 腸内細菌叢はもう1つの臓器
     5章 腸内細菌叢のバランスを変化させる要因
      1 食事
      2 生活習慣
      3 薬物療法
      4 加齢
      5 環境
      6 出生経路,乳児期の栄養方法の違い
      7 宿主遺伝要因
      8 おわりに
     6章 腸内細菌叢のバランス異常(dysbiosis)と疾患
      1 消化器疾患
      2 代謝性疾患
      3 がん
      4 免疫系疾患
      5 循環器疾患

    第III部 腸内環境制御(腸内デザイン)へのアプローチ
     7章 腸内環境を “見る” 方法
      1 ヒト腸内細菌叢メタゲノム解析手法
      2 ヒト腸内環境のメタボローム解析手法
      3 メタボロゲノミクス
     8章 腸内環境を “知る” 方法
      1 細菌の単離・培養・保管
      2 無菌動物とノトバイオート動物
      3 オルガノイドを用いた解析
      4 統計および数理・生態学的アプローチ
     9章 腸内環境を “操る” 方法
      1 プレバイオティクス
      2 プロバイオティクス
      3 ポストバイオティクス
      4 ファージ療法
      5 便移植療法の現状と展望

    第IV部 腸内細菌叢研究の実用化の試み
     10章 腸内細菌叢を標的とした医薬品開発
      1 生菌製剤(単菌/カクテル)
      2 腸内細菌に作用する低分子薬
      3 腸内細菌創薬の課題点と今後の展望
      4 マイクロバイオーム創薬の産業化動向
     11章 腸内環境に基づく層別化医療・創薬・ヘルスケア
      1 腸内環境情報を活用した病気の診断・予測
      2 腸内環境情報を活用した近未来の層別化医療・創薬・ヘルスケア

この書籍の参考文献

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本参考文献は電子書籍掲載内容を元にしております。

第I部 腸内細菌の基礎知識

P.21 掲載の参考文献
1) 光岡知足 : 腸内菌叢研究の歴史. 実験医学, 32 : 652-657, 2014
2) 「健康長寿のための食生活」 (光岡知足/著), 岩波書店, 2002
3) 「腸内細菌学」 (光岡知足/編), 朝倉書店, 1990
4) Escherich T : Fortschr Med, 3 : 515, 1885
5) テルモ株式会社「医療の挑戦者たち 30 破傷風菌の純粋培養」 https://www.terumo.co.jp/story/ad/challengers/30 (2022年8月閲覧)
6) 大野博司, 中込治 : 細菌の正しい日本語でのよび方. 実験医学, 30 : 3168-3169, 2012
7) 伊藤研「分類ってなに? -『界・門・綱・目・科・属・種』の話-」https://lab.mykinso.com/chisiki/classification/ (2022年8月閲覧)
8) 武田洋幸「理学のキーワード : ゲノム」https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/story/newsletter/keywords/01/04.html (2022年8月閲覧)
9) Sender R, et al : PLoS Biol, 14 : e1002533, 2016
10) Lederberg J : Science, 288 : 287-293 2000
11) 「明かされる "もう1つの臓器" 腸内細菌叢を制御せよ! 」 (福田真嗣/企画), 実験医学 Vol.34 No.6, 2016
P.33 掲載の参考文献
1) Woese CR, et al : Proc Natl Acad Sci U S A, 87 : 4576-4579, 1990
2) Gill SR, et al : Science, 312 : 1355-1359, 2006
3) Kurokawa K, et al : DNA Res, 14 : 169-181, 2007
4) Mullard A : Nature, 453 : 578-580, 2008
5) MetaHIT Consortium. : Nat Biotechnol, 32 : 834-841, 2014
6) 服部正平 : Jpn J Clin Immunol, 37 : 412-422, 2014
7) 仲田崇志 : Microbiol Cult Coll, 28 : 135-147, 2012
8) Euzeby JP : Int J Syst Bacteriol, 47 : 590-592, 1997
9) International Committee on Systematics of Bacteria : Int J Syst Bacteriol, 30 : 225-420, 1980
10) 平山和宏 : 腸内細菌学雑誌, 30 : 5-15, 2016
11) Oren A & Garrity GM : Int J Syst Evol Microbiol, 71 : doi : 10.1099/ijsem.0.005056, 2021
12) Parte AC, et al : Int J Syst Evol Microbiol, 70 : 5607-5612, 2020
13) Sender R, et al : PLoS Biol, 14 : e1002533, 2016
14) 「腸内細菌叢生態学」 (福田真嗣/企画), 実験医学 Vol.38 No.18, 2020
15) Atarashi K, et al : Science, 358 : 359-365, 2017
16) Nakamoto N, et al : Nat Microbiol, 4 : 492-503, 2019
17) Yachida S, et al : Nat Med, 25 : 968-976, 2019
18) Okumura S, et al : Nat Commun, 12 : 5674, 2021
20) Wu GD, et al : Science, 334 : 105-108, 2011
21) Nakayama J, et al : Sci Rep, 5 : 8397, 2015
24) Gordon HA, et al : J Gerontol, 21 : 380-387, 1966
25) Schnupf P, et al : Nature, 520 : 99-103, 2015
28) Prakash T, et al : Cell Host Microbe, 10 : 273-284, 2011
29) Kim SW, et al : DNA Res, 20 : 241-253, 2013
32) Vijay-Kumar M, et al : Science, 328 : 228-231, 2010
P.46 掲載の参考文献

第II部 腸内細菌叢とヒトの疾患

P.55 掲載の参考文献
1) 「腸内菌の世界-嫌気性菌の分離と同定」 (光岡知足/著), 叢文社, 1980
2) Kim SW, et al : DNA Res, 20 : 241-253, 2013
3) Maldonado-Gomez MX, et al : Cell Host Microbe, 20 : 515-526, 2016
4) Hehemann JH, et al : Nature, 464 : 908-912, 2010
5) Desai MS, et al : Cell, 167 : 1339-1353.e21, 2016
6) Mishima E, et al : J Am Soc Nephrol, 26 : 1787-1794, 2015
7) Diaz Heijtz R, et al : Proc Natl Acad Sci U S A, 108 : 3047-3052, 2011
8) Hsiao EY, et al : Cell, 155 : 1451-1463, 2013
9) Sampson TR, et al : Cell, 167 : 1469-1480.e12, 2016
10) Nishiwaki H, et al : NPJ Parkinsons Dis, 8 : 65, 2022
11) Ichinohe T, et al : Research Square, doi : 10.21203/rs.3.rs-1654765/v1, 2022
P.70 掲載の参考文献
1) Wu GD, et al : Science, 334 : 105-108, 2011
2) Hildebrandt MA, et al : Gastroenterology, 137 : 1716-24.e1, 2009
3) ANR MicroObes consortium. : Nature, 500 : 585-588, 2013
4) Meta HIT consortium. : Nature, 500 : 541-546, 2013
5) Smits SA, et al : Science, 357 : 802-806, 2017
6) Yu D, et al : Am J Clin Nutr, 113 : 684-694, 2021
7) O'Keefe SJ, et al : Nat Commun, 6 : 6342, 2015
9) Odamaki T, et al : Benef Microbes, 7 : 473-484, 2016
10) Sonnenburg ED & Sonnenburg JL : Cell Metab, 20 : 779-786, 2014
11) Bifulco M : Eur J Clin Nutr, 69 : 1078, 2015
12) Saji N, et al : Nutrition, 94 : 111524, 2022
13) Asano M, et al : Biosci Biotechnol Biochem, 84 : 1475-1485, 2020
14) Kushida M, et al : J Nutr Biochem, 64 : 121-127, 2019
15) Frost F, et al : Gut, 70 : 522-530, 2021
16) Chen L, et al : Cell, 184 : 2302-2315.e12, 2021
17) Sonnenburg ED, et al : Nature, 529 : 212-215, 2016
18) Tanes C, et al : Cell Host Microbe, 29 : 394-407.e5, 2021
19) Ranaivo H, et al : Gut Microbes, 14 : 2044722, 2022
20) Hentges DJ, et al : Cancer Res, 37 : 568-571, 1977
21) Benno Y & Mitsuoka T : Bifidobact Microflora, 10 : 89-96, 1991
22) Singh RK, et al : J Transl Med, 15 : 73, 2017
23) Fava F, et al : Int J Obes (Lond), 37 : 216-223, 2013
24) Watson H, et al : Gut, 67 : 1974-1983, 2018
25) Ang QY, et al : Cell, 181 : 1263-1275.e16, 2020
26) Tang L, et al : J Nutr, 151 : 2175-2187, 2021
27) Lilja S, et al : Int J Mol Sci, 22 : 2331, 2021
28) von Schwartzenberg RJ, et al : Nature, 595 : 272-277, 2021
29) Sowah SA, et al : Genome Med, 14 : 30, 2022
30) Biedermann L, et al : PLoS One, 8 : e59260, 2013
31) Yu G, et al : Microbiome, 5 : 3, 2017
32) Clarke SF, et al : Gut, 63 : 1913-1920, 2014
33) Barton W, et al : Gut, 67 : 625-633, 2018
34) Petersen LM, et al : Microbiome, 5 : 98, 2017
35) Scheiman J, et al : Nat Med, 25 : 1104-1109, 2019
36) Jang LG, et al : J Int Soc Sports Nutr, 16 : 21, 2019
37) Mailing LJ, et al : Exerc Sport Sci Rev, 47 : 75-85, 2019
38) Holdeman LV, et al : Appl Environ Microbiol, 31 : 359-375, 1976
39) Siddiqui R, et al : J Appl Microbiol, 130 : 14-24, 2021
40) Yusof N, et al : Gut Pathog, 9 : 75, 2017
41) Rao AV, et al : Gut Pathog, 1 : 6, 2009
42) David LA, et al : Genome Biol, 15 : R89, 2014
43) Thaiss CA, et al : Cell, 159 : 514-529, 2014
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46) Langdon A, et al : Genome Med, 8 : 39, 2016
61) Wu H, et al : Nat Med, 23 : 850-858, 2017
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96) Backhed F, et al : Cell Host Microbe, 17 : 690-703, 2015
97) Dominguez-Bello MG, et al : Nat Med, 22 : 250-253, 2016
108) Fan W, et al : J Microbiol Biotechnol, 24 : 133-143, 2014
130) Bonder MJ, et al : Nat Genet, 48 : 1407-1412, 2016
132) Ishida S, et al : Commun Biol, 3 : 686, 2020
136) Yang H, et al : Nature, 606 : 358-367, 2022
137) Qin Y, et al : Nat Genet, 54 : 134-142, 2022
P.89 掲載の参考文献
1) Kamada N, et al : Nat Rev Immunol, 13 : 321-335, 2013
8) Plovier H, et al : Nat Med, 23 : 107-113, 2017
9) Qin J, et al : Nature, 490 : 55-60, 2012
10) Karlsson FH, et al : Nature, 498 : 99-103, 2013
13) Vijay-Kumar M, et al : Science, 328 : 228-231, 2010
18) MetaHIT Consortium. : Nature, 535 : 376-381, 2016
20) Miyamoto J, et al : Nat Commun, 10 : 4007, 2019
21) Kimura I, et al : Science, 367 : eaaw8429, 2020
24) Han YW : Curr Opin Microbiol, 23 : 141-147, 2015
30) Wirbel J, et al : Nat Med, 25 : 679-689, 2019
31) Thomas AM, et al : Nat Med, 25 : 667-678, 2019
32) Yachida S, et al : Nat Med, 25 : 968-976, 2019
33) Okumura S, et al : Nat Commun, 12 : 5674, 2021
39) Loo TM, et al : Cancer Discov, 7 : 522-538, 2017
40) Yamagishi R, et al : Sci Immunol, 7 : eabl7209, 2022
43) Vetizou M, et al : Science, 350 : 1079-1084, 2015
46) Routy B, et al : Science, 359 : 91-97, 2018
48) Davar D, et al : Science, 371 : 595-602, 2021
49) Baruch EN, et al : Science, 371 : 602-609, 2021
54) Wang Z, et al : Nature, 472 : 57-63, 2011
56) Tang WH, et al : J Am Coll Cardiol, 64 : 1908-1914, 2014
64) Jie Z, et al : Nat Commun, 8 : 845, 2017

第III部 腸内環境制御 ( 腸内デザイン ( R ) ) へのアプローチ

P.101 掲載の参考文献
2) Thomas AM, et al : Nat Med, 25 : 667-678, 2019
3) Wirbel J, et al : Nat Med, 25 : 679-689, 2019
5) Caporaso JG, et al : Nat Methods, 7 : 335-336, 2010
7) Amir A, et al : mSystems, 2 : doi : 10.1128/mSystems.00191-16, 2017
8) Callahan BJ, et al : Nat Methods, 13 : 581-583, 2016
10) Li J, et al : Nat Biotechnol, 32 : 834-841, 2014
11) Mitchell AL, et al : Nucleic Acids Res, 48 : D570-D578, 2020
18) Parks DH, et al : Genome Res, 25 : 1043-1055, 2015
22) Forster SC, et al : Nat Biotechnol, 37 : 186-192, 2019
25) 実験医学別冊「メタボロミクス実践ガイド」 (馬場健史, 他/編), 羊土社, 2021
26) 福田真嗣 : メタボロミクスを基盤とした腸内環境研究. 実験医学別冊NGS アプリケーション「メタゲノム解析実験プロトコール」 (服部正平/編), pp181-186, 羊土社, 2016
27) Yamamoto Y, et al : Microorganism, 6 : 101, 2018
28) Ishii C, et al : Int J Mol Sci, 19 : 4079, 2018
P.124 掲載の参考文献
1) 「腸内菌の世界-嫌気性菌の分類と同定」 (光岡知足/著), 叢文社, 1980
1) 坂根健, 他 : Microbiol Cult Coll, 12 : 91-97, 1996
2) Tanaka T, et al : Appl Environ Microbiol, 80 : 7659-7666, 2014
2) 大和田勉 : Microbiol Cult Coll, 21 : 73-76, 2005
3) Lagier JC, et al : Nat Rev Microbiol : 540-550, 2018
4) Tanaka Y & Benno Y : Microbiol Immunol, 59 : 63-70, 2015
5) Afrizal A, et al : Environ Microbiol : 24 : 3861-3881, 2022
6) Banno I & Sakane T : IFO Res Comm, 10 : 33-38, 1981
7) Hirayama K : J Germfree Life Gnotobiol, 39 : 35-37, 2009
8) Heneghan JB : Physiology of the alimentary tract.「The Germ-free Animal in Biomedical Research」 (Coates ME & Gustafsson BE, eds), pp169-191, Laboratory Animals, 1984
9) Coates ME & FullerR : The gnotobiotic animal in the study of gut microbiology.「Microbial Ecology of the Gut」 (Clark RTJ & Bauchop T, eds), pp311-346, Academic Press, 1977
10) Gustafsson BE : Scand J Gastroenterol Suppl, 77 : 117-131, 1982
11) 平山和宏 : 無菌動物とノトバイオート技術. 「今すぐ始める! メタゲノム解析実験プロトコール」 (服部正平/編), pp176-180, 2016
12) Sato T, et al : Nature, 459 : 262-265, 2009
13) Sato T, et al : Gastroenterology, 141 : 1762-1772, 2011
14) 「決定版 オルガノイド実験スタンダード」 (佐藤俊朗, 武部貴則, 永樂元次/編), 羊土社, 2019
15) Hofer M, et al : Nat Rev Mater, 6 : 402-420, 2021
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26) Kleine Bardenhorst S, et al : mSystems, 6 : e01154-20, 2021
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28) Griffin NW, et al : Cell Host Microbe, 21 : 84-96, 2017
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第IV部 腸内細菌叢研究の実用化の試み

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63) Shepherd ES, et al : Nature, 557 : 434-438, 2018
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